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Cancer Cell Line Encyclopedia(CCLE):
https://portals.broadinstitute.org/ccle
细胞系是很多基础研究的同学主要的研究的对象,也是体外实验不可缺少的步骤,我们往往会想知道某个基因在某个细胞系的表达情况,为啥呢?
因为如果该细胞有某种表型B比如增殖能力强,和对照细胞相比,其A基因明显高表达,那我们就有理由推测A基因和B表现可能有关。
有时候我们也要知道某个基因在某个细胞系的基础表达量,如何获取呢?
Cancer Cell Line Encyclopedia(CCLE):
https://portals.broadinstitute.org/ccle
CCLE是Broad研究所与诺华研究基金会联合开发的在线数据库,大家看到界面很简洁,直接输入你想查的Genes或者细胞系,就可以了。目前,该数据库已经收录1100多种细胞系的基因信息,并实现了可视化,包含拷贝数,mRNA表达(Affy),RPPA,RRBS和mRNA表达(RNAseq)...
也可在Search完基因后,在"Scatter Plots"---"Compare to"---"Different Gene"中找Gene A和Gene B在该细胞系中的表达趋势。
(本文转自:弗雷赛斯)
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GMT+8, 2024-9-26 15:35
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