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抓住领域关键文献——Hiscite

已有 7644 次阅读 2017-4-27 14:35 |个人分类:Tools|系统分类:科研笔记| 科研软件

介绍:

      Hiscite是一个引文图谱分析软件。它可以对大量文献进行分析,然后根据它们的被引用数及相互之间引用关系做出可视化图谱,快速描绘出陌生领域的发展脉络,找到关键文献和明星科学家。

      每篇文献就像黑夜里的一个打火机,而每次引用就像为它添了一根柴,引用数量越多,文献越亮,一眼看过去,就越明显。而Hisctie就是把这种数字关系进行图谱化,提取出最亮的文献让我们能够一眼看出哪些文献被引最多,而这些文献往往也是最重要的。


下载

百度云盘(免安装):pan.baidu.com/s/1qXDzf9E

官网下载: ip-science.thomsonreuters.com/thanks/histcite/


适用范围:

1.     需要在短时间内快速了解一个陌生领域;

2.     查找本领域关键性论文;

3.     查找本领域权威科学家;

4.     了解本领域发展趋势。


缺点:

1.     Hiscite显示的是被引次数最多的文献,而越老的文献可能有更多的引用,因而新的文献容易被忽略;

2.     HisciteThomson Reuters公司开发,故只支持web of science数据库导出的文献,所有使用Hiscite软件的前提是拥有该数据库的权限,这可以到所在院所的图书馆查询;

3.     只在Web of science数据库使用关键词搜索易遗漏一些重要文献。



使用教程:一、导入文献:

1.     下载Hiscite软件

2.     打开Web of science主页,选择核心数据库。

图1:Web of science主页

3.     进行关键词搜索。以 "stem cell" 为例。
4.    
出现的搜索结果界面。


"1" 为搜索到的文献数。

"2" 为文献的排列顺序参数,有时间,被引次数,相关性等。

"3" 为导出格式。

"4" 是排列序号。

图2:搜索结果界面

5.     选择排列参数为 "1":被引次数——由高到低。导出格式为 "2":保存为其它文件格式。


图3:导出格式1

6.     每次只能导出500条记录,故在 "1" 处填写范围 "1-500",下次导出时改为 "501-1000"以此类推。"2"处选择:所有记录和参考文献。可以看到,搜索"stem cell"368114个结果,若所有都导出,太麻烦。但前面我们选择按照被引次数由高到低排列,即前面导出的都是被引较多的文献,因而导出适量文献即可,而不用全部导出。"3"处选择导出为纯文本,选择send导出。

图4:导出格式2

7.     文件会自动下载,若未自动下载,点击 "send"

8.     打开文档,将标红处的 "1"Science改为 "2"Knowledge


图5:文档修改

9.     将下载并改好的文档直接拖动到Hiscite软件图标上,Hiscite会自动打开。如图6,7,并自动弹出一个网页界面,即Hiscite的分析结果。

图6

图7




二、文献分析:

1. 网页界面参数分析:


图8:文献分析结果

"1":该领域研究概况。

      "Authors"可以找本领域大牛科学家;

      "Journals"可以定位本领域关键期刊;

      "Words"可以找到领域内关键词;

      "Yearly output", "DocumentType", "Institution", "County"等可以了解本领域文献在时间,类型,机构及国家等的分布情况。


"2":依次为按照"日期","作者名","杂志名"排序,作用不大。


  "3":关键参数:

LCS = local citation score ,即本地引用次数,它表示这篇文章在当前数据集中被引用的次数。以图8中第一篇文献为例。它在导入的7801篇文献中被引用了2次。如果一篇文献的LCS值越高,代表这这篇文献在"stem cell"领域越重要。

GCS = global citation score ,即总引用频次,它表示这篇文章被整个WOS数据库中所有文献引用的次数。GCS高表示这篇文献有较大影响力,但它并不一定在"stem cell"领域也同样重要。

LCR = local cited references ,本地参考文献数,它表示这篇文献的参考文献在当前数据集中的数量,即这篇文献引用别人的情况。如果一篇文章的 LCR 值高,意味着它引用了大量的 "stem cell" 领域内文献,极有可能是综述文章。

CR = cited references ,参考文献数,它表示这篇文章的参考文献在整个 WOS 数据库中的数量。
简而言之, LCS LCR 更重要,它们分别代表了与本领域相关联的被引用数和引用数, LCS 值高的文章一般是重要的新发现或者新解释, LCR 值高的一般是综述类文章。



2. 引文图谱分析:

点击上方菜单栏 "Tools – Graph maker",会弹出图谱界面,点击 "maker graph"生成引文图谱。


引文图谱界面参数:

图9:引文图谱

"1":参数栏。调整图中方块,线条,字体等。关键是 "LCS"和"limit"(图中文献数量)的选择。

"2":年份。

"3"LCS(本地数据库被引用量)最高的30篇文献及它们之间的引用关系图。

"4"LCS最高的30篇文献排序。

"5"和"6":被大量引用,为"stem cell"领域开创性论文。

"7":引用较多文献,一般为综述。

线条表示引用关系。如"6"引用了"5"

每个圆代表一篇文献,LCS值越高,圆面积越大。

点击感兴趣文献,可以查看该文献的详细信息。




补充漏网文献


1.     使用关键词搜索可能会漏掉一些重要文献。点击图10的"Cited References",出现的文献列表中有一些绿色的加号,表示未被本地数据集收录。"Recs"表示该文献在本地数据集中的被引次数。

图10:遗漏的重要文献

2.    复制未收录文献的DOI号,到Web of science搜索界面搜索

图11:DOI搜索


3. 选择搜索到的文献,然后点击"Add to Marked List",会在"3"处的"Marked list"显示数量。  

4. 选择”select all”,然后选择”Save to other filefomats”,在弹出的界面中选择”plaintext”,发送。记得在下载的文档中修改”Science”为”Knowledge”。


Hiscite是个易用却功能强大的软件,本文只介绍了其基本的功能,还有更多的技巧有待发掘。


参考:

ztever.com/histcite-manu/

blog.sciencenet.cn/blog-304685-383399.html

zhuanlan.zhihu.com/p/20902898




https://blog.sciencenet.cn/blog-1331820-1051523.html


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