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郑爱萍研究员等在DNA Research上发表论文

已有 5361 次阅读 2016-7-4 18:14 |个人分类:论文简介|系统分类:科研笔记| 水稻纹枯病, RilRNA, 致病机制

郑爱萍研究员等DNA Research上发表论文

揭示MilRNA调控水稻纹枯病的致病机制

       201673日,《DNA研究》(DNA ResearchIF: 5.267)刊发了四川农业大学水稻研究所郑爱萍研究员等的研究论文“Comprehensive analysis of microRNA-Seq and target mRNAs of rice sheath blight pathogen provides new insights into pathogenic regulatory mechanisms”该文揭示了纹枯病菌MilRNA参与的致病机制。

       microRNA (miRNA) 是调控靶基因的一类重要小RNA。在真菌中存在类似miRNA的小RNAmilRNA),可能受到分析方法的局限,目前报道的milRNA数目非常少(在多个真菌中普遍少于45个)。本文作者开发了一个分析真菌小RNA的流程,并应用该方法第一次识别出水稻纹枯病菌的milRNA。基于侵染水稻过程的小RNA数据,共发现有177milRNA653个靶基因(mRNA),根据靶基因的功能、侵染阶段的milRNA以及mRNA的表达量信息确定15milRNA与致病相关;采用RT-qPCR/RT-PCR验证milRNA的存在,并使用双荧光表达载体验证了Rhi-milR-16与靶基因相互作用的准确性。根据侵染阶段milRNA-mRNA相互作用,推测milRNA主要行使三个方面的调控:1)调控ABC-G转运蛋白和水解酶hydrolase(即把水稻防御反应中产生的抗真菌化合物转运或者降解掉)参与致病过程;2)调控参与信号传导途径的致病因子;3)调控细胞壁降解酶的表达,而细胞壁降解酶参与侵染水稻的过程。

       外,本文还发现有23个水稻免疫相关的miRNA对水稻纹枯病菌的侵染反应,这些miRNA调控一些已有报道的参与抗病相关的基因(比如MYB转录因子和激酶)第一次发现水稻miRNA对死体寄生真菌(水稻纹枯病菌)的防御反应有别于对半死体寄生真菌(稻瘟病菌)的防御反应

       这些结果为进一步研究病原菌的致病机制,以及病原菌与寄主的相互作用提供了重要的基础

林润茂(现为北师大博士生)与贺利业(2012级硕士)为本文共同第一作者,李平教授与郑爱萍研究员为共同通讯作者,四川农业大学为唯一作者单位。

论文链接:http://dnaresearch.oxfordjournals.org/cgi/reprint/dsw024?ijkey=EFOounQg2Vgm45h&keytype=ref




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