博文
Gadget工作日志
|||
20131221
Gadget是著名的星系、宇宙学模拟程序。我期望能用来模拟分子云的碰撞。王乔说，安装Gadget一定要逐字逐句看手册，我显然没有理解这句话的含义。我只记住需要安装fftw和gsl，这两个库安装起来都不难，安装手册上要求的选项
[xxx@xxx]$ ./configure --enable-mpi --enable-double
[xxx@xxx]$ sudo make
[xxx@xxx]$ sudo make install
安装fftw
[xxx@xxx]$ ./configure
[xxx@xxx]$ sudo make
[xxx@xxx]$ sudo make install
安装gsl
由于组内的服务器上有mpi，所以不用重新安装。但是准备好这些前期工作之后，编译Gadget总是出错，有一个头文件“rfftw_mpi.h”找不到。我尝试重新安装fftw，修改configure选项，都没有用。失败将近十次之后又看了一遍手册，手册上说，目前Gadget只能使用fftw 2.x版，fftw 3版会出错。果然，我用的就是fftw 3，因为下载页上fftw 2.x位于不起眼的地方。
于是重新下载安装fftw 2.x，然后再编译Gadget，没有出同样的错，但是还是没有通过。研究了一下，需要修改Makefile里fftw库的路径和gsl库的路径，还需要修改和fftw相关的编译选项。修改之后编译就可以产生可执行文件Gadget2了。
运行Gadget2的时候可以使用Gadget2/parameterfiles文件夹里的.param文件，可能需要修改此文件中的一些路径。尤其是需要根据文件中的路径创建相应的输出文件夹，输出文件不用创建。
然后就可以运行Gadget2了，不用mpi的话就直接
[xxx@xxx]$ ./Gadget2 xxx.param
https://blog.sciencenet.cn/blog-117333-751656.html
上一篇：思考文明的基础——读《柯俊传》
下一篇：热力学统计物理温故——读《玻尔兹曼——笃信原子的人》
扫一扫，分享此博文
全部作者的精选博文
- • 天文与我
- • 观测简介2019-2020
- • 射电天文简介和中性氢观测
- • 作为天线的FAST
- • 金牛座分子云三维结构的探索
- • 观测简介