hayidahubei的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/hayidahubei

博文

[转载]CDS, Exon, intron, utr的定义

已有 4401 次阅读 2018-12-15 05:50 |个人分类:基因组注释信息|系统分类:科研笔记| exon, intron, UTR, 外显子, 内含子

参考连接:
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/embl/doc/FT_current.html


CDS: coding sequence; sequence of nucleotides that corresponds with the sequence of 
amino acids in a protein (location includes stop codon); feature includes amino acid 
conceptual translation.
 
Exon: region of genome that codes for portion of spliced mRNA, rRNA and tRNA; may 
contain 5'UTR, all CDSs and 3' UTR;
 
Intron: a segment of DNA that is transcribed, but removed from within the transcript 
by splicing together the sequences (exons) on either side of it;
 
mRNA: messenger RNA; includes 5'untranslated region (5'UTR), coding sequences (CDS, 
exon) and 3'untranslated region (3'UTR);
 
precursor_RNA: any RNA species that is not yet the mature RNA product; may include 
ncRNA, rRNA, tRNA, 5' untranslated region (5'UTR), coding sequences (CDS, exon), 
intervening sequences (intron) and 3' untranslated region (3'UTR);
 
rRNA: mature ribosomal RNA; RNA component of the ribonucleoprotein particle (ribosome) 
which assembles amino acids into proteins.
 
tRNA: mature transfer RNA, a small RNA molecule (75-85 bases long) that mediates the 
translation of a nucleic acid sequence into an amino acid sequence
 
3'UTR: 1) region at the 3' end of a mature transcript (following the stop codon) that 
is not translated into a protein; 2) region at the 3' end of an RNA virus (following the last stop codon) that is not translated into a protein;
 
5'UTR: 1) region at the 5' end of a mature transcript (preceding the initiation codon) 
that is not translated into a protein; 2) region at the 5' end of an RNA virus genome 
(preceding the first initiation codon) that is not translated into a protein;




https://blog.sciencenet.cn/blog-1113671-1151607.html

上一篇:虚拟机Ubuntu中添加硬盘
下一篇:利用liftOver进行不同版本的坐标转换
收藏 IP: 130.91.194.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-20 07:38

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部